RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SOCS5	O75159	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PIGN	O95427	931 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ASMTL	O95671	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NUDT17	P0C025	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CTSS	P25774	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PTPN6	P29350	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CDC25B	P30305	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KRT2	P35908	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF165	P49910	485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NUDT6	P53370	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CLDN10	P78369	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GNA12	Q03113	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CD69	Q07108	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NCOA4	Q13772	614 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CNGA3	Q16281	694 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	STX1A	Q16623	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DLG3	Q92796	817 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NTAN1	Q96AB6	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	C3orf18	Q9UK00	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772		K7EIL1	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DSCR3	O14972	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	MAP3K7	O43318	606 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NUAK1	O60285	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PDE5A	O76074	875 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	FBXO21	O94952	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	VNN1	O95497	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	YEATS4	O95619	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IL2RA	P01589	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OPN1MW	P04001	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TPM3	P06753	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	EPHA1	P21709	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CDH3	P22223	829 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OR1E1	P30953	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	RFC3	P40938	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GPR1	P46091	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	ME1	P48163	572 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	LMAN1	P49257	510 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	AP3M2	P53677	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DSC2	Q02487	901 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	STK38	Q15208	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	NFIL3	Q16649	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CARD9	Q9H257	536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSI2-216	ENST00000582772	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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