RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	EXT2	Q93063	718 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SGPP1	Q9BX95	441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CD244	Q9BZW8	370 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CEP250	Q9BV73	2442 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OR5K3	A6NET4	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	BTN3A3	O00478	584 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	B4GAT1	O43505	415 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	GFRA3	O60609	400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	TRIM13	O60858	407 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	STK16	O75716	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	FKBP9	O95302	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	MYF5	P13349	255 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ALDH3A1	P30838	453 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	DAB2	P98082	770 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ASPH	Q12797	758 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NAE1	Q13564	534 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	LIPM	Q5VYY2	423 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	LCTL	Q6UWM7	567 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SPRED1	Q7Z699	444 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NETO1	Q8TDF5	533 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PHF21B	Q96EK2	531 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NRTN	Q99748	197 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	MIPEP	Q99797	713 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	XKR8	Q9H6D3	395 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CPED1	A4D0V7	1026 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232		K7EPI3	171 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	E2F3	O00716	465 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	TM4SF5	O14894	197 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	TNFSF14	O43557	240 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PROS1	P07225	676 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NPPB	P16860	134 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	KCNA4	P22459	653 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CD1C	P29017	333 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ALDH4A1	P30038	563 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	CAPZB	P47756	277 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PIK3CG	P48736	1102 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	HSPA7	P48741	367 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	AGTR2	P50052	363 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OR1D5	P58170	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	TBPL1	P62380	186 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ILK	Q13418	452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PERM1	Q5SV97	790 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-211	ENST00000582232	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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