RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 GHDCQ8N2G8 530 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 HSPH1Q92598 858 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 DLG3Q92796 817 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SCMH1Q96GD3 660 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 VPS50Q96JG6 964 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PWWP2AQ96N64 755 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TSGA13Q96PP4 275 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SCN2AQ99250 2005 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 STMN3Q9NZ72 180 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 HIVEP2P31629 2446 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZANQ9Y493 2812 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A0J9YY10 115 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PRRG2O14669 202 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF8O76064 485 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CD48P09326 243 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RARAP10276 462 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 DESP17661 470 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PTGER1P34995 402 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 HMGCLP35914 325 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 EFNA3P52797 238 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ARSFP54793 590 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF33BQ06732 778 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZBTB17Q13105 803 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PRKG2Q13237 762 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NOMO1Q15155 1222 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 BCL7AQ4VC05 210 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CNSTQ6PJW8 725 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CD163Q86VB7 1156 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TADA1Q96BN2 335 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 AGPAT1Q99943 283 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CCM2Q9BSQ5 444 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 HGH1Q9BTY7 390 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 KLHL1Q9NR64 748 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CUTCQ9NTM9 273 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 C3orf18Q9UK00 162 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ANK2Q01484 3957 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF212BA8MTL3 300 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TTI1O43156 1089 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 MLYCDO95822 493 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RAF1P04049 648 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PYGMP11217 842 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP1A3P13637 1013 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PDHA2P29803 388 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PCK1P35558 622 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 RAB28P51157 221 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 FANCCQ00597 558 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TUBA3CQ13748 450 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 PCSK7Q16549 785 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.29□□□□□ -1.24
SMARCE1-217ENST00000580654 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.29□□□□□ -1.24
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