RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 E7EVH7 732 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 F8W8V4 182 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SOCS6O14544 535 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RASGRF2O14827 1237 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DSCR3O14972 297 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KLHL41O60662 606 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 S1PR4O95977 384 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RPN2P04844 631 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 APOA4P06727 396 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARSFP54793 590 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRAMEP78395 509 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NKG7Q16617 165 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TM9SF4Q92544 642 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NACC2Q96BF6 587 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC26A1Q9H2B4 701 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 WDR54Q9H977 334 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CUTCQ9NTM9 273 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CTSFQ9UBX1 484 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CDC23Q9UJX2 597 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ITPR2Q14571 2701 aa16.01■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CENPEQ02224 2701 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KRT87PA6NCN2 255 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKUB1A6NFN9 424 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ALBP02768 609 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 APRTP07741 180 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ITGA3P26006 1051 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COL8A1P27658 744 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FIGLAQ6QHK4 219 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NLRP9Q7RTR0 991 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C1orf54Q8WWF1 131 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PEX13Q92968 403 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 P2RY12Q9H244 342 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF148Q9UQR1 794 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRBAP50851 2863 aa16■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NRP2O60462 931 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CTSVO60911 334 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MED26O95402 600 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PSMB5P28074 263 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GLRBP48167 497 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CRADDP78560 199 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SNX1Q13596 522 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GRM7Q14831 915 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HIF1AQ16665 826 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TCTE1Q5JU00 501 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF787Q6DD87 383 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 IGFL2Q6UWQ7 119 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DENND1AQ8TEH3 1009 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NFS1Q9Y697 457 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKRD12Q6UB98 2062 aa15.99■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FITM1A5D6W6 292 aa15.98■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C1orf105O95561 183 aa15.98■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BDKRB1P46663 353 aa15.98■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR1D4P47884 311 aa15.98■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TTPAP49638 278 aa15.98■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TMED2Q15363 201 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms