RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CS-229	ENST00000551936	KRT87P	A6NCN2	255 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	TARM1	B6A8C7	271 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	DPM1	O60762	260 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	AVIL	O75366	819 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	FKBP9	O95302	570 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ONECUT2	O95948	504 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	UMOD	P07911	640 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ITGAX	P20702	1163 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ALAS2	P22557	587 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	MAGEA6	P43360	314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	DLG3	Q92796	817 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	TCF12	Q99081	682 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	GPR83	Q9NYM4	423 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936		A0A1W2PPV9	198 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	VPS4B	O75351	444 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	MATN4	O95460	622 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	KRT14	P02533	472 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	MCM3	P25205	808 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	PSMB5	P28074	263 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CCNF	P41002	786 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	VPS41	P49754	854 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	GPS1	Q13098	491 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	RAPSN	Q13702	412 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	TCTE1	Q5JU00	501 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ARMC3	Q5W041	872 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CENPU	Q71F23	418 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	COX15	Q7KZN9	410 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936		Q8NA96	180 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	C5AR2	Q9P296	337 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	PCM1	Q15154	2024 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936		A0A1B0GX78	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	FITM1	A5D6W6	292 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936		H3BMM5	538 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	MASP2	O00187	686 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	PEX12	O00623	359 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	DSCR3	O14972	297 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	PFDN6	O15212	129 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CTSV	O60911	334 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	IGHE	P01854	428 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ALB	P02768	609 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	ESR1	P03372	595 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CHRM3	P20309	590 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	GNLY	P22749	145 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	SOX8	P57073	446 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-229	ENST00000551936	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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