RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ACADLP28330 430 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ADSSP30520 456 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CXCR5P32302 372 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CCR9P51686 369 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ARSDP51689 593 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R50P59544 299 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SSX7Q7RTT5 188 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM124AQ86V42 546 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR7G3Q8NG95 312 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PHF12Q96QT6 1004 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AGAP2Q99490 1192 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RIPK3Q9Y572 518 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR14I1A6ND48 311 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 DFNA5O60443 496 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF623O75123 536 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LATS1O95835 1130 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 VIPP01282 170 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CAPNS1P04632 268 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ITGAVP06756 1048 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 APRTP07741 180 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 STAG3L3P0CL85 134 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GALP22466 123 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SEZ6Q53EL9 994 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC38Q5VT99 294 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MCFD2Q8NI22 146 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TADA1Q96BN2 335 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IGSF21Q96ID5 467 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OR2AT4A6NND4 320 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PRODHO43272 600 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 OPN1LWP04000 364 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SPARCP09486 303 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ALPIP09923 528 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 RHOQP17081 205 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LBPP18428 481 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 AGXTP21549 392 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CHMP24386 653 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PCGF2P35227 344 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK10P53779 464 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ITGA1P56199 1179 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CTAG1AP78358 180 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MERTKQ12866 999 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TAF10Q12962 218 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LACC1Q8IV20 430 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NAXEQ8NCW5 288 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IL31RAQ8NI17 732 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NELL1Q92832 810 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 IL25Q9H293 177 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 EXO5Q9H790 373 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 USE1Q9NZ43 259 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A2O15244 555 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 LILRB5O75023 590 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ACSL3O95573 720 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 MLNP12872 115 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 KCNE1P15382 129 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 CYP2F1P24903 491 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SCNN1AP37088 669 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 SLC1A2P43004 574 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 BRCC3P46736 316 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.18□□□□□ -1.42
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