RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FKBP10Q96AY3 582 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NACC2Q96BF6 587 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF778Q96MU6 729 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF148Q9UQR1 794 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NTNG1Q9Y2I2 539 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MAU2Q9Y6X3 613 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SOCS6O14544 535 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 RASGRF2O14827 1237 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 DSCR3O14972 297 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ALBP02768 609 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 APRTP07741 180 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ITGAXP20702 1163 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PSMA3P25788 255 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FDFT1P37268 417 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 DCTP40126 519 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF75DP51815 510 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CDC16Q13042 620 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SNX1Q13596 522 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM214AQ32MH5 1076 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TUBB8Q3ZCM7 444 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FCRL6Q6DN72 434 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FIGLAQ6QHK4 219 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 UNC5DQ6UXZ4 953 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF534Q76KX8 674 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CCDC89Q8N998 374 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 VPS50Q96JG6 964 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SPSB2Q99619 263 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 DESI2Q9BSY9 194 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CARD6Q9BX69 1037 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 WDR54Q9H977 334 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CTSFQ9UBX1 484 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.63□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A0J9YVX5 310 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 WIPF3A6NGB9 483 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 LIASO43766 372 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 GPC4O75487 556 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SUN1O94901 812 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 UQCRHP07919 91 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ERVK-10P10266 1014 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ETS1P14921 441 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 AOAHP28039 575 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 BDKRB1P46663 353 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TTPAP49638 278 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OCA2Q04671 838 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 GRB7Q14451 532 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 WASHC2DQ5SRD0 308 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CNSTQ6PJW8 725 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 KIRREL2Q6UWL6 708 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 COX15Q7KZN9 410 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 DTWD1Q8N5C7 304 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 GRHL3Q8TE85 626 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP4R1Q8TF05 950 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PANX3Q96QZ0 392 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MIPEPQ99797 713 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CRB3Q9BUF7 120 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MENTQ9BUN1 341 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 LHPPQ9H008 270 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms