RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 SQSTM1Q13501 440 aa24.88■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 SETDB1Q15047 1291 aa24.88■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa24.88■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.88■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 MIPEPQ99797 713 aa24.88■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 SLC17A7Q9P2U7 560 aa24.88■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 LAMA1P25391 3075 aa24.88■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PIPSLA2A3N6 862 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 C2orf74A8MZ97 194 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 STK16O75716 305 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 OAS2P29728 719 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ETV4P43268 484 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CAPZBP47756 277 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 NAE1Q13564 534 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.578e-9■■■■■ 31.4
STIP1-208ENST00000540501 HHATQ5VTY9 493 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 SPRED1Q7Z699 444 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 GLRX5Q86SX6 157 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 IL17FQ96PD4 163 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CCDC3Q9BQI4 270 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 XKR8Q9H6D3 395 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 HRASLS2Q9NWW9 162 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 EPHA6Q9UF33 1036 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa24.87■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 OR6C74A6NCV1 312 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 A8MT66 165 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 G3V2L1 256 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 BIRC5O15392 142 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 DLX3O60479 287 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CCNDBP1O95273 360 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 SLC6A12P48065 614 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PIK3CGP48736 1102 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 DNAJB13P59910 316 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 E2F1Q01094 437 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 NAA25Q14CX7 972 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PLXDC1Q8IUK5 500 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 HAUS8Q9BT25 410 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CD244Q9BZW8 370 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 TWSG1Q9GZX9 223 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ATG10Q9H0Y0 220 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 OXSMQ9NWU1 459 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CIDEBQ9UHD4 219 aa24.86■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 B4GAT1O43505 415 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 MYF5P13349 255 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 NR1D1P20393 614 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 OR1D5P58170 312 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PTCHD3Q3KNS1 767 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PERM1Q5SV97 790 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 LCTLQ6UWM7 567 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD42Q8N9B4 389 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 PHF21BQ96EK2 531 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ZDHHC12Q96GR4 267 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CD180Q99467 661 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 SGPP1Q9BX95 441 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 LRRN3Q9H3W5 708 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 OPTCQ9UBM4 332 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ZNF292O60281 2723 aa24.85■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ISM1B1AKI9 464 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 BTN3A3O00478 584 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 SLC30A4O14863 429 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 TAPBPO15533 448 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 TRIM13O60858 407 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 DHRS4L1P0CG22 281 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 IMPDH1P20839 514 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 SERPINB4P48594 390 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ACADVLP49748 655 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 TBPL1P62380 186 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 HERVK_113P63132 956 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ABATP80404 500 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 LIPMQ5VYY2 423 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 CARFQ8N187 725 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 MED8Q96G25 268 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 ERVK-6Q9BXR3 956 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 GPRC5BQ9NZH0 403 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 KCNE2Q9Y6J6 123 aa24.84■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 DNAH14Q0VDD8 3507 aa24.83■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 GSAPA4D1B5 854 aa24.83■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 KRT87PA6NCN2 255 aa24.83■■□□□ 1.57
STIP1-208ENST00000540501 K7EPI3 171 aa24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms