RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 VRK3Q8IV63 474 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 MYCT1Q8N699 235 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 TMIEQ8NEW7 156 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 HES6Q96HZ4 224 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SGCZQ96LD1 299 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SH3GL2Q99962 352 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 LHX5Q9H2C1 402 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 EBF3Q9H4W6 596 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 TASP1Q9H6P5 420 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SYBUQ9NX95 663 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 PKD2L2Q9NZM6 624 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SPATA2Q9UM82 520 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.66□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 PRSS38A1L453 326 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 MTMR11A4FU01 709 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 TMEM210A6NLX4 147 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SLC22A1O15245 554 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 MED24O75448 989 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 PIGNO95427 931 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ABHD16AO95870 558 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 TBX18O95935 607 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CCNA2P20248 432 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CYP3A5P20815 502 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 DRD1P21728 446 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CCND1P24385 295 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 GSTM2P28161 218 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 PKLRP30613 574 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ME1P48163 572 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 AIF1P55008 147 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 DCAF7P61962 342 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 GPR17Q13304 367 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 MPP5Q8N3R9 675 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ICA1LQ8NDH6 482 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 TANKQ92844 425 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 HDAC10Q969S8 669 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 PTERQ96BW5 349 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 IQCDQ96DY2 449 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 LRGUKQ96M69 825 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 MMS19Q96T76 1030 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CTRCQ99895 268 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 NUP85Q9BW27 656 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SLC32A1Q9H598 525 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 GKN1Q9NS71 199 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SCOCQ9UIL1 159 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 VPS28Q9UK41 221 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 SNX7Q9UNH6 387 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 CCL26Q9Y258 94 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 ZNF175Q9Y473 711 aa7.65□□□□□ -1.18
LMO3-212ENST00000535535 STK36Q9NRP7 1315 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 OR6C75A6NL08 312 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 AHRRA9YTQ3 701 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 PFDN6O15212 129 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 NRP2O60462 931 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 FMO6PO60774 539 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 ATP6V1G2O95670 118 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 RALAP11233 206 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 GYPEP15421 78 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 RAB4AP20338 218 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-212ENST00000535535 BCKDHBP21953 392 aa7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms