RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517907.1

IGHVII-1-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-1-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-1-1, Length 180 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SOX8P57073 446 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 GRM7Q14831 915 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 TCTE1Q5JU00 501 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 COX15Q7KZN9 410 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 VRK3Q8IV63 474 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 KRT222Q8N1A0 295 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 OR4L1Q8NH43 312 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 VPS50Q96JG6 964 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 AGAP4Q96P64 663 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SPSB2Q99619 263 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CTSFQ9UBX1 484 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa9.01□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 WIPF3A6NGB9 483 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ENO4A6NNW6 628 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 IQCF5A8MTL0 148 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SOCS6O14544 535 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 RASGRF2O14827 1237 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 GPC4O75487 556 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ALBP02768 609 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ADRA1DP25100 572 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 GCGRP47871 477 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 OR1D4P47884 311 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 PER3P56645 1201 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CDC16Q13042 620 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SEMA3AQ14563 771 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 NKG7Q16617 165 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CRB2Q5IJ48 1285 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 FCRL6Q6DN72 434 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 TTC23LQ6PF05 361 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 FIGLAQ6QHK4 219 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ZNF534Q76KX8 674 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 NLRP9Q7RTR0 991 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 TXLNBQ8N3L3 684 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 RAB42Q8N4Z0 105 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 COG1Q8WTW3 980 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 NACC2Q96BF6 587 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ZNF778Q96MU6 729 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CRB3Q9BUF7 120 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 MENTQ9BUN1 341 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CARD6Q9BX69 1037 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 LHPPQ9H008 270 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ETNK1Q9HBU6 452 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SEMA3GQ9NS98 782 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CATSPERZQ9NTU4 200 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 OSGIN2Q9Y236 505 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 MAU2Q9Y6X3 613 aa9□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CENPEQ02224 2701 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SEC16AO15027 2179 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 E2F3O00716 465 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 MAP2K7O14733 419 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 LIASO43766 372 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 SUN1O94901 812 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 FKBP9O95302 570 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 UQCRHP07919 91 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ERVK-10P10266 1014 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ACPPP15309 386 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 AOAHP28039 575 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 PSMB5P28074 263 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 GRIA1P42261 906 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 TTPAP49638 278 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ZNF75DP51815 510 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 OCA2Q04671 838 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 ACVR1Q04771 509 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHVII-1-1-201ENST00000517907 KIF5AQ12840 1032 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms