RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	INIP	Q9NRY2	104 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ATP6V1E1	P36543	226 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MXD1	Q05195	221 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	AQP6	Q13520	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	UPP1	Q16831	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SYTL3	Q4VX76	610 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLIC1	O00299	241 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TYMP	P19971	482 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q6ZSR9	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ITPA	Q9BY32	194 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TNFRSF11B	O00300	401 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDH12	P55289	794 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	NDUFA5	Q16718	116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	DLGAP1	O14490	977 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SELP	P16109	830 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ENG	P17813	658 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	STARD8	Q92502	1023 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	DYRK4	Q9NR20	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2B6	P58173	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ITIH1	P19827	911 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RCVRN	P35243	200 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PPP5C	P53041	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PHC1	P78364	1004 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CACNG1	Q06432	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SULT1C4	O75897	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ASB1	Q9Y576	335 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRT87P	A6NCN2	255 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMCC2	O75069	709 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRT20	P35900	424 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC34A3	Q8N130	599 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUL1	Q969V5	352 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms