RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CUTCQ9NTM9 273 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MAST4O15021 2626 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TARM1B6A8C7 271 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 RASGRF2O14827 1237 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 DSCR3O14972 297 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ETS1P14921 441 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGAXP20702 1163 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP11P24347 488 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIA3P42263 894 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SEMA3AQ14563 771 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 C4orf22Q6V702 233 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 OTOAQ7RTW8 1153 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC6Q86X45 466 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC01555Q8NAE3 123 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 C19orf60Q96EN9 201 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 IL17FQ96PD4 163 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR54Q9H977 334 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 BFARQ9NZS9 450 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 FLNCQ14315 2725 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0U1RQJ8 604 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 UMODP07911 640 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 NPY2RP49146 381 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 NR6A1Q15406 480 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS6KA1Q15418 735 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 GSTA5Q7RTV2 222 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM139Q8IV31 216 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MPP5Q8N3R9 675 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SPC24Q8NBT2 197 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 IL22Q9GZX6 179 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ASF1BQ9NVP2 202 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM169AQ9Y6X4 670 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ESPL1Q14674 2120 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CCNFP41002 786 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CCNG2Q16589 344 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 FCRL6Q6DN72 434 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 PRUNE1Q86TP1 453 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 AGAP4Q96P64 663 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MENTQ9BUN1 341 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 CBX6O95503 412 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf105O95561 183 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 RPL22P35268 128 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXL2P58012 376 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 OCA2Q04671 838 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 GRB7Q14451 532 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 NAA25Q14CX7 972 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 RBBP7Q16576 425 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 NKG7Q16617 165 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 COG1Q8WTW3 980 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC26A1Q9H2B4 701 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SEMA3GQ9NS98 782 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC22A11Q9NSA0 550 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXL4Q9UKA2 621 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-220ENST00000511663 A1L4Q6 167 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 HYKKA2RU49 373 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 MASP2O00187 686 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 ONECUT2O95948 504 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 MCM3P25205 808 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 MRNIPQ6NTE8 343 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 Q6ZS92 163 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJB14Q8TBM8 379 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 C5orf34Q96MH7 638 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 MIPEPQ99797 713 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 P2RY12Q9H244 342 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF304Q9HCX3 659 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC6A20Q9NP91 592 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC5A6Q9Y289 635 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms