RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508652.5

TMA16-205, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 2

Gene TMA16, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-205	ENST00000508652	RBBP7	Q16576	425 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	MIPEP	Q99797	713 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	HAUS8	Q9BT25	410 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SGPP1	Q9BX95	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ASB1	Q9Y576	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LRP4	O75096	1905 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	TRIM38	O00635	465 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	GIPC1	O14908	333 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PPM1D	O15297	605 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ITM2A	O43736	263 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LRP3	O75074	770 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LSP1	P33241	339 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CDC16	Q13042	620 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LCP2	Q13094	533 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	NR0B2	Q15466	257 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	INAVA	Q3KP66	663 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	EID2	Q8N6I1	236 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	KY	Q8NBH2	561 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LNP1	A1A4G5	178 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	OR6C74	A6NCV1	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CLGN	O14967	610 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SIGLEC6	O43699	453 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	OTC	P00480	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	GLB1	P16278	677 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	NPPB	P16860	134 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	TSPAN8	P19075	237 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CCNG1	P51959	295 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PKNOX1	P55347	436 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	TBPL1	P62380	186 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CSRP2	Q16527	193 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	NRTN	Q99748	197 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PI4KA	P42356	2102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	LILRA5	A6NI73	299 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMA16-205	ENST00000508652	ZW10	O43264	779 aa		13.72	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms