RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	THAP4	Q8WY91	577 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ING5	Q8WYH8	240 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SPSB4	Q96A44	273 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	HPDL	Q96IR7	371 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SERAC1	Q96JX3	654 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	B3GALT6	Q96L58	329 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CNPY3	Q9BT09	278 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	VCX2	Q9H322	139 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MUC13	Q9H3R2	512 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NGB	Q9NPG2	151 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KLK14	Q9P0G3	267 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NUP50	Q9UKX7	468 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX12	Q9UMY4	172 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TFR2	Q9UP52	801 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KCTD3	Q9Y597	815 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0A6YYH2	397 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971		A6NJ64	397 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MATN3	O15232	486 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	B4GAT1	O43505	415 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NOBOX	O60393	691 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LPXN	O60711	386 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	KAT7	O95251	611 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CH25H	O95992	272 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FABP1	P07148	127 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4E1	P0C645	316 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RARA	P10276	462 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ITGA4	P13612	1032 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PFKL	P17858	780 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MSR1	P21757	451 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCD3	P28288	659 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	HTR7	P34969	479 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CD79B	P40259	229 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RAD23B	P54727	409 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ITGA1	P56199	1179 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TNNC1	P63316	161 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ECT2L	Q008S8	904 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CDH17	Q12864	832 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NAB1	Q13506	487 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BFSP2	Q13515	415 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR68	Q15743	365 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	C6orf183	Q5T699	404 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC38	Q5VT99	294 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	DUPD1	Q68J44	220 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TSSK4	Q6SA08	328 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BBS12	Q6ZW61	710 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR141	Q7Z602	305 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MISP	Q8IVT2	679 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR150	Q8NGU9	434 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM71B	Q8TC56	605 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	NCSTN	Q92542	709 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	EDA	Q92838	391 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	LPP	Q93052	612 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM84A	Q96KN4	292 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	PKP2	Q99959	881 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FBXO38-208	ENST00000504971	SEMA3C	Q99985	751 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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