RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502571.1

FBXO38-204, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 2

Gene FBXO38, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-204	ENST00000502571	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	LMX1B	O60663	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	GSR	P00390	522 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	KRT83	P78385	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TAF10	Q12962	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	EID3	Q8N140	333 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	PIGB	Q92521	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	PROX1	Q92786	737 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	PSMD14	O00487	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ARPC2	O15144	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CIDEA	O60543	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC22A3	O75751	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	MOCS3	O95396	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	HSD17B3	P37058	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	GSDMD	P57764	484 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	PTEN	P60484	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TAF13	Q15543	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	STPG4	Q8N801	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	RAD54L	Q92698	747 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CORO2A	Q92828	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	EPYC	Q99645	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	FAM170A	A1A519	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SLC7A4	O43246	635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	MUT	P22033	750 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CDH3	P22223	829 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	KRT2	P35908	639 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	RGS7	P49802	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	MTCP1	P56278	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TUBB4B	P68371	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	PHEX	P78562	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	PTK6	Q13882	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	PHKG1	Q16816	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FBXO38-204	ENST00000502571	NODAL	Q96S42	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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