RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	GALNT16	Q8N428	558 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	NDC1	Q9BTX1	674 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		11.43	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	APOA4	P06727	396 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CDC25B	P30305	580 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	TERF1	P54274	439 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	MYBPC3	Q14896	1274 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	PTER	Q96BW5	349 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	TTC1	Q99614	292 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	MIPEP	Q99797	713 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	PAK5	Q9P286	719 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CTSF	Q9UBX1	484 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.42	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A1B0GX78	115 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269		A0A1W2PPV9	198 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269		A1L4Q6	167 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	PEX12	O00623	359 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	C1orf105	O95561	183 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	MGAT1	P26572	445 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	OR1D4	P47884	311 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	NR6A1	Q15406	480 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	NKG7	Q16617	165 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CNST	Q6PJW8	725 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CUZD1	Q86UP6	607 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	IP6K3	Q96PC2	410 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SPSB2	Q99619	263 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.41	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	SOCS6	O14544	535 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	DSCR3	O14972	297 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	KDM1A	O60341	852 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	AVIL	O75366	819 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	NDUFS3	O75489	264 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	VAPB	O95292	243 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	ONECUT2	O95948	504 aa		11.4	□□□□□ -0.58
FAM204A-208	ENST00000487269	S1PR4	O95977	384 aa		11.4	□□□□□ -0.58

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