RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 SIX5Q8N196 739 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SIRPGQ9P1W8 387 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.07□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CDH7Q9ULB5 785 aa13.07□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 ZNF840PA6NDX5 716 aa13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 FAM92BQ6ZTR7 304 aa13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NXPE1Q8N323 547 aa13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SPTA1P02549 2419 aa13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GIPC3Q8TF64 312 aa13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 IGSF8Q969P0 613 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CLIC1O00299 241 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 AXIN1O15169 862 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 STAT5AP42229 794 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC18A1P54219 525 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GJD3Q8N144 294 aa13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 KCNJ9Q92806 393 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA1191Q96A73 305 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 COPS7AQ9UBW8 275 aa13.06□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 STON1Q9Y6Q2 735 aa13.06□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 SNPHO15079 494 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RGS10O43665 173 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 FADS2O95864 444 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 COL21A1Q96P44 957 aa13.05□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 ZNF487B1APH4 448 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 GRID2O43424 1007 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC18A2Q05940 514 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OAFQ86UD1 273 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RELTQ969Z4 430 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC39A3Q9BRY0 314 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CDADC1Q9BWV3 514 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C4AP0C0L4 1744 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 C4BP0C0L5 1744 aa13.05□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.05□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 REM1O75628 298 aa13.05□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 PREPP48147 710 aa13.05□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 WDR60Q8WVS4 1066 aa13.05□□□□□ -0.32
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HDLBP-241ENST00000487169 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 SLC26A3P40879 764 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 CRISP3P54108 245 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ACTR3P61158 418 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 DLG1Q12959 904 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 ACSBG2Q5FVE4 666 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 OR4F3Q6IEY1 312 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 MCFD2Q8NI22 146 aa13.04□□□□□ -0.32
HDLBP-241ENST00000487169 RGMAQ96B86 450 aa13.04□□□□□ -0.32
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