RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 LIFP15018 202 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FDXRP22570 491 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 GUCY2DQ02846 1103 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CYS1Q717R9 158 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 OLFM1Q99784 485 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FANCEQ9HB96 536 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.19■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 PIAS1O75925 651 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 C1QAP02745 245 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 MAGP20916 626 aa20.18■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CCDC25Q86WR0 208 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 DLG3Q92796 817 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 SPTBP11277 2137 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB14O43829 449 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN12O95859 305 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 PSMB5P28074 263 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 RGS4P49798 205 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FCRL6Q6DN72 434 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 OR2A1Q8NGT9 310 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.17■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 SLC16A8O95907 504 aa20.16■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.16■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 SMPDL3AQ92484 453 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 LINGO1Q96FE5 620 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 LHX9Q9NQ69 397 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 IL17BQ9UHF5 180 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 PADI1Q9ULC6 663 aa20.16■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.15■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.15■□□□□ 0.82
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ACTB-211ENST00000480301 CDKL2Q92772 493 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 LRFN5Q96NI6 719 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 MIPEPQ99797 713 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 RHOJQ9H4E5 214 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 CROTQ9UKG9 612 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 PDE10AQ9Y233 779 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-211ENST00000480301 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.15■□□□□ 0.82
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