RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PATE1Q8WXA2 126 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 JADE3Q92613 823 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 ZNF778Q96MU6 729 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 EBF4Q9BQW3 602 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 ABCG8Q9H221 673 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 WDR26Q9H7D7 661 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 GPAMQ9HCL2 828 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.435e-8■■■■□ 19.4
MITF-215ENST00000478490 ARMCX1Q9P291 453 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 XPR1Q9UBH6 696 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SUFUQ9UMX1 484 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CDYLQ9Y232 598 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.12□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PRSS38A1L453 326 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 A8MUI8 341 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 ZNF195O14628 629 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 INPP4BO15327 924 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 NOBOXO60393 691 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SOCS5O75159 536 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 FKBP6O75344 327 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TNFSF15O95150 251 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CLDN7O95471 211 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SLC4A1P02730 911 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CEACAM5P06731 702 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 MMP2P08253 660 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PIRTP0C851 137 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 THRAP10827 490 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SAT1P21673 171 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PSMA3P25788 255 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 GABRB3P28472 473 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 GPR1P46091 355 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 LSSP48449 732 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 EPHB1P54762 984 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 OR1D5P58170 312 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 MPP1Q00013 466 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 IRF9Q00978 393 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CTBP1Q13363 440 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 GALNT3Q14435 633 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 MAPRE2Q15555 327 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 AMZ1Q400G9 498 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 LRRC66Q68CR7 880 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 AAGABQ6PD74 315 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 C16orf89Q6UX73 402 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 NRROSQ86YC3 692 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TREML1Q86YW5 311 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 NAT6Q93015 286 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SCAMP4Q969E2 229 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 DTD2Q96FN9 168 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TCF12Q99081 682 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SERPINI1Q99574 410 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PRORYQ9H606 182 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 COG4Q9H9E3 785 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 BATF3Q9NR55 127 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 PNPOQ9NVS9 261 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 ZNF358Q9NW07 568 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.11□□□□□ -1.43
MITF-215ENST00000478490 TMCO1Q9UM00 188 aa6.11□□□□□ -1.43
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