RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475451.1

MIA3-208, Transcript of MIA SH3 domain ER export factor 3, human

TSL 3

Gene MIA3, Length 552 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIA3-208	ENST00000475451	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451		E7EVH7	732 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	SLC30A4	O14863	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	FOXS1	O43638	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	GAS8	O95995	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	SOD1	P00441	154 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	KRT14	P02533	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PCCB	P05166	539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CD1A	P06126	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PIRT	P0C851	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	TPSB2	P20231	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	HMGCL	P35914	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	TRIM23	P36406	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	RXRG	P48443	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	SPINT3	P49223	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	LMAN1	P49257	510 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CCT8	P50990	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	THOP1	P52888	689 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CLDN2	P57739	230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	DCDC1	P59894	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PDE1B	Q01064	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CDH17	Q12864	832 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	FOXL1	Q12952	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	OLIG2	Q13516	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	NFATC4	Q14934	902 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	HLA-B	Q31612	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451		Q6ZSR6	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PARG	Q86W56	976 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	EID2B	Q96D98	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	TBATA	Q96M53	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MIA3-208	ENST00000475451	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIA3-208	ENST00000475451	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms