RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472045.1

IRF1-208, Transcript of interferon regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene IRF1, Length 5,153 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF1-208	ENST00000472045	IL7R	P16871	459 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	DPYS	Q14117	519 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	GJD3	Q8N144	294 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ADAM12	O43184	909 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	IFNW1	P05000	195 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	GALK1	P51570	392 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	RORB	Q92753	470 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	KLK1	P06870	262 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SLC7A9	P82251	487 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	INA	Q16352	499 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045		C9JVG2	144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	LDB2	O43679	373 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	NEK2	P51955	445 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		11.97	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	TJP1	Q07157	1748 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	UNC5C	O95185	931 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	JUP	P14923	745 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	DRD4	P21917	467 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	TDG	Q13569	410 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ZBP1	Q9H171	429 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	LCHN	A4D1U4	455 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	COQ9	O75208	318 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	CDH1	P12830	882 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ACRV1	P26436	265 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	EIPR1	Q53HC9	387 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	STX11	O75558	287 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	EDN1	P05305	212 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SLC7A1	P30825	629 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SOX9	P48436	509 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ACTR3	P61158	418 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	KCNC3	Q14003	757 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	USP53	Q70EK8	1073 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	BANP	Q8N9N5	519 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
IRF1-208	ENST00000472045	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045		A8MT66	165 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	HMGCS1	Q01581	520 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	NRF1	Q16656	503 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	OR1A2	Q9Y585	309 aa		11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
IRF1-208	ENST00000472045	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5

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