RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455546.6

GTF3C3-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GTF3C3, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3-208ENST00000455546 RANBP10Q6VN20 620 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PRSS42Q7Z5A4 293 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TMEM126BQ8IUX1 230 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 KATNAL2Q8IYT4 538 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TEX19Q8NA77 164 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 AVL9Q8NBF6 648 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 DDHD1Q8NEL9 900 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 CCDC110Q8TBZ0 833 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ACTL9Q8TC94 416 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 MR1Q95460 341 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 C1orf159Q96HA4 380 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SLC41A2Q96JW4 573 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 VAT1Q99536 393 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TLR10Q9BXR5 811 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TRIM5Q9C035 493 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 RAB33BQ9H082 229 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ACTL8Q9H568 366 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 XKR8Q9H6D3 395 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PDE7BQ9NP56 450 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 FGF21Q9NSA1 209 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 HACD3Q9P035 362 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 KCND3Q9UK17 655 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 RARRES3Q9UL19 164 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 POLHQ9Y253 713 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PCSK5Q92824 1860 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 RELNP78509 3460 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SCN3AQ9NY46 2000 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 KALRNO60229 2985 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 A0A0U1RQJ8 604 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ARGFXA6NJG6 315 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 A6NL46 340 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 C2orf81A6NN90 581 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 HACD1B0YJ81 288 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 MASP2O00187 686 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 BTN3A3O00478 584 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ZNF185O15231 689 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 HCRTR1O43613 425 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 LDB2O43679 373 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SCRG1O75711 98 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ANXA9O76027 345 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 MED26O95402 600 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 METTL18O95568 372 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 APOC2P02655 101 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 RBP3P10745 1247 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PYGMP11217 842 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 CDH3P22223 829 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 CTNNA2P26232 953 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PTPN4P29074 926 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 GEMP55040 296 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 HADHBP55084 474 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 FOXL2P58012 376 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TUBB4BP68371 445 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 HSD11B2P80365 405 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TEKQ02763 1124 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ACY1Q03154 408 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 MAP4K2Q12851 820 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 KLRB1Q12918 225 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 GPS2Q13227 327 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 LAPTM5Q13571 262 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SEMA5AQ13591 1074 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 IL10RAQ13651 578 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TUBB2AQ13885 445 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PRPSAP1Q14558 356 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 BRD3Q15059 726 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SPA17Q15506 151 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 CPZQ66K79 652 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 KLHL35Q6PF15 583 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 BBS12Q6ZW61 710 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 TAS2R42Q7RTR8 314 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C3-208ENST00000455546 FGD2Q7Z6J4 655 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms