RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 MAP7Q14244 749 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ESX1Q8N693 406 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 GALNT6Q8NCL4 622 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 OR8K5Q8NH50 307 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 IFT81Q8WYA0 676 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 RHOJQ9H4E5 214 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 KLHL20Q9Y2M5 609 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SDK2Q58EX2 2172 aa17.38■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ZZEF1O43149 2961 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 LAMA5O15230 3695 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 EFSO43281 561 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SCRG1O75711 98 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 NTRK1P04629 796 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 MSL3P1P0C860 447 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ERGP11308 486 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 MAGP20916 626 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 PSMB5P28074 263 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 HSD17B2P37059 387 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 IL2P60568 153 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 VAC14Q08AM6 782 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP19Q14CB8 494 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 DEFB110Q30KQ9 67 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP40Q5TG30 622 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 TMEM126BQ8IUX1 230 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 CTAGE3PQ8IX95 158 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 OR1L3Q8NH93 324 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 FBF1Q8TES7 1133 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 VPS39Q96JC1 886 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 MCMBPQ9BTE3 642 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 TXNDC16Q9P2K2 825 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa17.37■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 PKD1L2Q7Z442 2459 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PPV9 198 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ZNF839A8K0R7 811 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 K7ENP7 123 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 FKBP9O95302 570 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 TSPAN12O95859 305 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SLC16A8O95907 504 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 C1QAP02745 245 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 MT-ND3P03897 115 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 C8GP07360 202 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 LIFP15018 202 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 CYP2A7P20853 494 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 STX2P32856 288 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 PNLIPRP1P54315 467 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 TAS2R39P59534 338 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ABHD18Q0P651 414 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SP140Q13342 867 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SUSD1Q6UWL2 747 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 GPR155Q7Z3F1 870 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 PPFIBP2Q8ND30 876 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ZNF480Q8WV37 535 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SMPDL3AQ92484 453 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 DLG3Q92796 817 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 MIPEPQ99797 713 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 CPNE1Q99829 537 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SERTAD3Q9UJW9 196 aa17.36■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 CACNA1BQ00975 2339 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ZFHX4Q86UP3 3567 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SLC16A5O15375 505 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 HCRTR1O43613 425 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 WT1P19544 449 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 GP5P40197 560 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 GABRA4P48169 554 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ITGA1P56199 1179 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ZNF460Q14592 562 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 FIGLAQ6QHK4 219 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 TMEM207Q6UWW9 146 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 CEP128Q6ZU80 1094 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SYTL1Q8IYJ3 562 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 PPM1NQ8N819 430 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 OR2L3Q8NG85 312 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 OR2A1Q8NGT9 310 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 MCOLN3Q8TDD5 553 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 RBBP8Q99708 897 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 SLC12A9Q9BXP2 914 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 PDE10AQ9Y233 779 aa17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
HERC3-205ENST00000426683 E7EQ34 232 aa17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms