RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 SMU1Q2TAY7 513 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 AGKQ53H12 422 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 XKR7Q5GH72 579 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 OGFOD2Q6N063 350 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 C16orf89Q6UX73 402 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 MIER2Q8N344 545 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 OXR1Q8N573 874 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.45□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 SHDQ96IW2 340 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 C3orf30Q96M34 536 aa6.45□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 APOOQ9BUR5 198 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.45□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.45□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SGK2Q9HBY8 427 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CD248Q9HCU0 757 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 KLC4Q9NSK0 619 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF225Q9UK10 706 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 OR1A2Q9Y585 309 aa6.45□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1B0GTL3 188 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 KRBA1A5PL33 1030 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF839A8K0R7 811 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 MEI4A8MW99 385 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 MANBAO00462 879 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 FFAR3O14843 346 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 AIM2O14862 343 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 GPR42O15529 346 aa6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 HTR1BP28222 390 aa6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 HSD17B2P37059 387 aa6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 IRF8Q02556 426 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 EMX2Q04743 252 aa6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SYT13Q7L8C5 426 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PDZD3Q86UT5 571 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.44□□□□□ -1.38
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