RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR8K5Q8NH50 307 aa16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCTN2Q96GX1 697 aa16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKP4Q99569 1192 aa16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBBP8Q99708 897 aa16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RHOXF2Q9BQY4 288 aa16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ULBP3Q9BZM4 244 aa16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC16A5O15375 505 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FKBP9O95302 570 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1QAP02745 245 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSL3P1P0C860 447 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERGP11308 486 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITPKBP27987 946 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OAS2P29728 719 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP1A2P50993 1020 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNLIPRP1P54315 467 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UCNP55089 124 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAS2R39P59534 338 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POU4F1Q01851 419 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TLE3Q04726 772 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR19Q15760 415 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRTP1Q5TC63 336 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DTX1Q86Y01 620 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMPDL3AQ92484 453 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NINJ2Q9NZG7 142 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.75■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAD1O60671 282 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPAN12O95859 305 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC16A8O95907 504 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST1H2ADP20671 130 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAGP20916 626 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGGT1BP53609 377 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TGIF1Q15583 401 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYTH2Q99418 400 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR22Q99680 433 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PARVBQ9HBI1 364 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPAMQ9HCL2 828 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFU1Q9UMS0 254 aa16.74■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA0754O94854 1291 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACSL3O95573 720 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSMB5P28074 263 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMPRSS3P57727 454 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF460Q14592 562 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLMAPQ14BN4 828 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAA25Q14CX7 972 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZIC1Q15915 447 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MANEAQ5SRI9 462 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL22RA1Q8N6P7 574 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRN4CLQ8ND94 238 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF480Q8WV37 535 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC138Q96M89 665 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIPEPQ99797 713 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDE10AQ9Y233 779 aa16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1W2PPV9 198 aa16.72■□□□□ 0.27
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ESPNB1AK53 854 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms