RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.68□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CACNA1BQ00975 2339 aa3.68□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NFAT5O94916 1531 aa3.68□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa3.68□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTC21AQ8NDW8 1320 aa3.68□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD163L1Q9NR16 1453 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL18A1P39060 1754 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 J3QR06 171 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IKBKBO14920 756 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CTDSPLO15194 276 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPIP5K2O43314 1243 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SSX4O60224 188 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLHL41O60662 606 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRAF2O60831 178 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RGS11O94810 467 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NFATC1O95644 943 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AK1P00568 194 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLAUP00749 431 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR2T7P0C7T2 308 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GZMAP12544 262 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDUFB7P17568 137 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UGT1A1P22309 533 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACRV1P26436 265 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTPN4P29074 926 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SOX6P35712 828 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRIA3P42263 894 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGEB1P43366 347 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSMC4P43686 418 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IER3P46695 156 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ME1P48163 572 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SULT1E1P49888 294 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 METAP1P53582 386 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAD23BP54727 409 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EFEMP1Q12805 493 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPP2Q13103 211 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCGB2A2Q13296 93 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MTA1Q13330 715 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPM6BQ13491 265 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DECR1Q16698 335 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB6CQ53S08 254 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC183Q5T5S1 534 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM71Q6P5X7 295 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 APCDD1Q8J025 514 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BATF2Q8N1L9 274 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TEX45Q8NA69 505 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPT2Q8TD30 523 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERGIC1Q969X5 290 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COQ10AQ96MF6 247 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF570Q96NI8 536 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRRX2Q99811 253 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATG101Q9BSB4 218 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB6CQ9H0N0 254 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLHL1Q9NR64 748 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF146Q9NTX7 359 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM161AQ9NX61 479 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RHCGQ9UBD6 479 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WDR37Q9Y2I8 494 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 U3KQV3 271 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIK3C2AO00443 1686 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ITSN1Q15811 1721 aa3.67□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNTNAP1P78357 1384 aa3.66□□□□□ -1.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms