RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CKAP2LQ8IYA6 745 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR18Q8N4B5 295 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1J1Q8NGS3 322 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR6X1Q8NH79 312 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLBD2Q8NHP8 589 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP61Q8NHU2 1237 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF461Q8TAF7 563 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHBDF1Q96CC6 855 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ORAI1Q96D31 301 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF570Q96NI8 536 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOK1Q99704 481 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TM2D3Q9BRN9 247 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIFC3Q9BVG8 833 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC32A1Q9H598 525 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMYD2Q9NRG4 433 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIGVQ9NUD9 493 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1456Q9P272 454 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLKQ9UBE8 527 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 STAP2Q9UGK3 403 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUSP12Q9UNI6 340 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERVW-1Q9UQF0 538 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 AUP1Q9Y679 476 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DGKBQ9Y6T7 804 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDZD2O15018 2839 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM234BA2RU67 622 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPIPB13A6NJU9 1138 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 C17orf100A8MU93 164 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLRF2D3W0D1 207 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPIPB9F8W1W9 429 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 C3orf84H3BNL1 204 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAS3O00219 553 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENPP3O14638 875 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IRAK2O43187 625 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLK8O60259 260 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 AVILO75366 819 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 VIPP01282 170 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IRF1P10914 325 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCNAP12004 261 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CKMT2P17540 419 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TECP42680 631 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT4P47944 62 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRIP1P48552 1158 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDST2P52849 883 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN2P57739 230 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTA1P68133 377 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTAG1AP78358 180 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAB1Q15750 504 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 UPP1Q16831 310 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 COBLL1Q53SF7 1204 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM83BQ5T0W9 1011 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAXCQ5TGI0 409 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGNBP1Q5YKI7 109 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR52W1Q6IF63 320 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM207Q6UWW9 146 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 C19orf35Q6ZS72 473 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 UNC13DQ70J99 1090 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPAINQ86UA6 219 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRROSQ86YC3 692 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA6LQ8N4H0 392 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC5A8Q8N695 610 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCAF4L2Q8NA75 395 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 THAP8Q8NA92 274 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10G2Q8NGC3 310 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5T2Q8NGG2 359 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR13F1Q8NGS4 319 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMPDL3BQ92485 455 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRAMD1AQ96CP6 724 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUCLG2Q96I99 432 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 VSIG2Q96IQ7 327 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAAR6Q96RI8 345 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYADMQ96S97 322 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 LHX5Q9H2C1 402 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 C10orf95Q9H7T3 257 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNPLA8Q9NP80 782 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGA3Q9NZ52 723 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms