RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 PMS2P54278 862 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 PNLIPRP1P54315 467 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBB3Q13509 450 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SF1Q15637 639 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 PHKG1Q16816 387 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC5A12Q1EHB4 618 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SUSD1Q6UWL2 747 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CEACAM20Q6UY09 585 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZFAND4Q86XD8 727 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 MCOLN3Q8TDD5 553 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF480Q8WV37 535 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 URB1O60287 2271 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A1W2PPV9 198 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC16A5O15375 505 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 BMPR2Q13873 1038 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGAP19Q14CB8 494 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR19Q15760 415 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZIC1Q15915 447 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TMTC4Q5T4D3 741 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TXLNGYQ9BZA5 131 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 B3GNT4Q9C0J1 378 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 PDE7BQ9NP56 450 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 FGF21Q9NSA1 209 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 USP24Q9UPU5 2620 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 HSD17B2P37059 387 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB10P61026 200 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ACY1Q03154 408 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 IL11RAQ14626 422 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 MROH9Q5TGP6 573 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SPATA6LQ8N4H0 392 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF248Q8NDW4 579 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SMPDL3AQ92484 453 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 MIPEPQ99797 713 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ACAT2Q9BWD1 397 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SDK2Q58EX2 2172 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CDC7O00311 574 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 RIPK2O43353 540 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 MAGP20916 626 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TNFRSF8P28908 595 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 IMPA1P29218 277 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 GMPRP36959 345 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC138Q96M89 665 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM60AQ9NP50 221 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 HMX2A2RU54 273 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 E7ENX8 843 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 MAP3K7O43318 606 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC166P0CW27 439 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 FGF5P12034 268 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 HIST1H2ADP20671 130 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 YBX1P67809 324 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBB4BP68371 445 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TAP2Q03519 686 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 SBSNQ6UWP8 590 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 RAPH1Q70E73 1250 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 TCTN2Q96GX1 697 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 PAFAH2Q99487 392 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZPBPQ9BS86 351 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 RARRES3Q9UL19 164 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 PCM1Q15154 2024 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF839A8K0R7 811 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 INHBAP08476 426 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 ABHD2P08910 425 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms