RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ASB9Q96DX5 294 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 LRGUKQ96M69 825 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FOPNLQ96NB1 174 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD27Q96NW4 1050 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PIF1Q9H611 641 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN10Q9UBB4 475 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAB1Q9Y478 270 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL27Q9Y4X3 112 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ASPDHA6ND91 283 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR23AA6NEV1 266 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLON5A6NGN9 336 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FXYD1O00168 92 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF4O60810 478 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC16A8O95907 504 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GSTM1P09488 218 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ACADSP16219 412 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC6A2P23975 617 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GALK1P51570 392 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PFN3P60673 137 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GSTM4Q03013 218 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GTF2H3Q13889 308 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TLR1Q15399 786 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 RABL3Q5HYI8 236 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM46CQ5VWP2 391 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PRMT9Q6P2P2 845 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 NLRP8Q86W28 1048 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 DHFR2Q86XF0 187 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 LIX1Q8N485 282 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF175Q8N4F7 328 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPEARQ8WU66 669 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 USP7Q93009 1102 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM74Q96NL1 305 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 DPY30Q9C005 99 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTL8Q9H568 366 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 HEBP1Q9NRV9 189 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CMTM6Q9NX76 183 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GULP1Q9UBP9 304 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SNX6Q9UNH7 406 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FADS3Q9Y5Q0 445 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM229AB2RXF0 380 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3BGRLO75368 114 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 EEDO75530 441 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PCCBP05166 539 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 DRD3P35462 400 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIA3P42263 894 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 DPTQ07507 201 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXC1Q12948 553 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 NFE2L1Q14494 772 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 STARD3Q14849 445 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CST6Q15828 149 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf27AQ580R0 203 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SFT2D3Q587I9 215 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 XKR6Q5GH73 641 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ALKBH2Q6NS38 261 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC23LQ6PF05 361 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.87□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms