RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 TMEM233B4DJY2 109 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 OR7A17O14581 309 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 DRD4P21917 467 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 NDUFS1P28331 727 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 PKLRP30613 574 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 RAB28P51157 221 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 LCP2Q13094 533 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 CUZD1Q86UP6 607 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 MAPK15Q8TD08 544 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 IPPKQ9H8X2 491 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 ZNF225Q9UK10 706 aa24.61■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 ARHGAP33O14559 1287 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SLC2A4P14672 509 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 HHEXQ03014 270 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 CYP2A13Q16696 494 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 TRMOQ9BU70 441 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 MID1IP1Q9NPA3 183 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 POT1Q9NUX5 634 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SPATA7Q9P0W8 599 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SH2B3Q9UQQ2 575 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 FIS1Q9Y3D6 152 aa24.6■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 EPB42P16452 691 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SERPINB5P36952 375 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 PLCL1Q15111 1095 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 CRLF3Q8IUI8 442 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 OR4E2Q8NGC2 313 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 AGAP11Q8TF27 550 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 LCN9Q8WX39 176 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SGPP1Q9BX95 441 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 PSMB5P28074 263 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 YBX1P67809 324 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SH2D4BQ5SQS7 431 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SYVN1Q86TM6 617 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 ARL14Q8N4G2 192 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 KYQ8NBH2 561 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 KCNA7Q96RP8 456 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 RAP2CQ9Y3L5 183 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa24.59■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 PCM1Q15154 2024 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 A0A1W2PPV9 198 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 KATNA1O75449 491 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 FOXA1P55317 472 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 TRAF3Q13114 568 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 CLEC6AQ6EIG7 209 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SLC9B2Q86UD5 537 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 SAP25Q8TEE9 199 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 ATP6V1E2Q96A05 226 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX15-202ENST00000377244 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa24.58■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 PPM1DO15297 605 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 PRAMEF4O60810 478 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 ENGP17813 658 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 CCNG1P51959 295 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 CDC16Q13042 620 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 PRKAA1Q13131 559 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 LETMD1Q6P1Q0 360 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 CCT8L2Q96SF2 557 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 NPHS2Q9NP85 383 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 MLYCDO95822 493 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 MYF5P13349 255 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 AMIGO1Q86WK6 493 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 RAB42Q8N4Z0 105 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 SUMF1Q8NBK3 374 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 ZNF382Q96SR6 550 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 SPHK1Q9NYA1 384 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 TAC3Q9UHF0 121 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 SPEGQ15772 3267 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 E7EQ34 232 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 OR4F21O95013 312 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 SYPP08247 313 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 NPPBP16860 134 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 HSD17B2P37059 387 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 PLA2G2CQ5R387 149 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 LAIR1Q6GTX8 287 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 OGFOD3Q6PK18 319 aa24.56■■□□□ 1.52
SNX15-202ENST00000377244 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms