RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SGO1Q5FBB7 561 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SFTPA1Q8IWL2 248 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM217AQ8IXS0 508 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 NXPE1Q8N323 547 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SMYD1Q8NB12 490 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MIPOL1Q8TD10 442 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 VOPP1Q96AW1 172 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 RDH12Q96NR8 316 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3GL1Q99961 368 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 LIMD1Q9UGP4 676 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 AGAP14A8MT82 685 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 B4GAT1O43505 415 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 IMPG1Q17R60 797 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FKBP9P1Q75LS8 142 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FIBINQ8TAL6 211 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 AREL1O15033 823 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SCELO95171 688 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CD247P20963 164 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SPAM1P38567 509 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 NEDD8Q15843 81 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKDD1AQ495B1 522 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 DET1Q7L5Y6 550 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TOR3AQ9H497 397 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf109Q9NX04 203 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 STK16O75716 305 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 BCKDHAP12694 445 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PBX2P40425 430 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPK8P45983 427 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 IST1P53990 364 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF554Q86TJ5 538 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PLPP6Q8IY26 295 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2AP1Q8NGE2 309 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TANKQ92844 425 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 BORCS5Q969J3 196 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ACDQ96AP0 544 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ULK4Q96C45 1275 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC47A1Q96FL8 570 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52E6Q96RD3 313 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 OSBPL10Q9BXB5 764 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A13Q9NSD5 602 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 AP3M1Q9Y2T2 418 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CXCR6O00574 342 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CST1P01037 141 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 EPORP19235 508 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MATN1P21941 496 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GGT5P36269 586 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TMBIM6P55061 237 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TTLL9Q3SXZ7 439 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 THAP5Q7Z6K1 395 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM210AQ96ND0 272 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM118AQ9NWS6 357 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC34A8MYJ7 566 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC14L2O76054 403 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 LHCGRP22888 699 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PHC1P78364 1004 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP2R2BQ00005 443 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF7Q14155 803 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GTDC1Q4AE62 458 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MICU2Q8IYU8 434 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR26Q8NDV2 337 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PJA1Q8NG27 643 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MBOAT4Q96T53 435 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TBCDQ9BTW9 1192 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ING2Q9H160 280 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTR8Q9H981 624 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 USE1Q9NZ43 259 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 INVSQ9Y283 1065 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKD3O94806 890 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN9O95484 217 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RETP07949 1114 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CBSLP0DN79 551 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPN2P17706 415 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CBSP35520 551 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NRIP1P48552 1158 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC23Q5W5X9 447 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG9BQ674R7 924 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC66Q68CR7 880 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR149Q86SP6 731 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CALHM3Q86XJ0 350 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HOMEZQ8IX15 550 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms