RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356175.7

NF1-201, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 12,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-201ENST00000356175 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.7□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CBLP22681 906 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SOX10P56693 466 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ZNF347Q96SE7 839 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 MAOBP27338 520 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 HLCSP50747 726 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 TAS2R40P59535 323 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 MPP1Q00013 466 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 RAB30Q15771 203 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 DTD1Q8TEA8 209 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 NELL1Q92832 810 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ITCHQ96J02 903 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 PALLDQ8WX93 1383 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CLUHO75153 1309 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ANK1P16157 1881 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 A0A0A6YYH2 397 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 MEIOCA2RUB1 952 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 A6NJ64 397 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 TCAPO15273 167 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 DRD5P21918 477 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 TMBIM6P55061 237 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 NRG3P56975 720 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 RGS1Q08116 209 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SCARF1Q14162 830 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SEC23BQ15437 767 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 FBXW5Q969U6 566 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 MOCOSQ96EN8 888 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 MICU1Q9BPX6 476 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 PREX2Q70Z35 1606 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 UBXN8O00124 270 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CHP2O43745 196 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SLC22A3O75751 556 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 UGT2B17O75795 530 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CSF1RP07333 972 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ARAFP10398 606 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 GRTP1Q5TC63 336 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 HASPINQ8TF76 798 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 UFD1Q92890 307 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 RIT2Q99578 217 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SLC29A1Q99808 456 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ATP8B3O60423 1300 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 TGOLN2O43493 480 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 RAB3DO95716 219 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 PRDX6P30041 224 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 17.9
NF1-201ENST00000356175 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CFL2Q9Y281 166 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 TIMM22Q9Y584 194 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 FSCN2O14926 492 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 PTTG1O95997 202 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 VIPR1P32241 457 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CHRNA4P43681 627 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SLC3A1Q07837 685 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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NF1-201ENST00000356175 Q6ZNX1 250 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 EXO5Q9H790 373 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SUV39H1O43463 412 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 PDGFAP04085 211 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 CDK1P06493 297 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 HDCP19113 662 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SLC7A1P30825 629 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 TCEA2Q15560 299 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.69□□□□□ -1.34
NF1-201ENST00000356175 SYNE4Q8N205 404 aa6.69□□□□□ -1.34
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