RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 PLOD2O00469 737 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SMPD1P17405 629 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GADD45AP24522 165 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SCARB2Q14108 478 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ECHDC2Q86YB7 292 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 OSTF1Q92882 214 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC46Q96FV0 321 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PHF12Q96QT6 1004 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM209Q96SK2 561 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 DERL2Q9GZP9 239 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SNX10Q9Y5X0 201 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CEP290O15078 2479 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 FFAR2O15552 330 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TSPAN9O75954 239 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CLPXO76031 633 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 NT5EP21589 574 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ABCG1P45844 678 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 DEFB132Q7Z7B7 95 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SLC32A1Q9H598 525 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 C8AP07357 584 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ABATP80404 500 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP206Q8IYR0 622 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA6LQ8N4H0 392 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GAL3ST4Q96RP7 486 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 NDC1Q9BTX1 674 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SCDO00767 359 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 BLMHQ13867 455 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 LIN52Q52LA3 116 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF227Q86WZ6 799 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GKN2Q86XP6 184 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 NAT14Q8WUY8 206 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 FKBP7Q9Y680 259 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 RP1P56715 2156 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 K7EPI3 171 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CLDN5O00501 218 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PIP5K1BO14986 540 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTS3O15072 1205 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 DFNA5O60443 496 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRT-201ENST00000356100 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHB18PQ96TA0 734 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRT-201ENST00000356100 COPS4Q9BT78 406 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TNFRSF10BO14763 440 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 DCLK1O15075 740 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PDYNP01213 254 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GIN1Q9NXP7 522 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 IL36AQ9UHA7 158 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SCML2Q9UQR0 700 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 RCCD1A6NED2 376 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SOX9P48436 509 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 GRIK5Q16478 980 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 JOSD2Q8TAC2 188 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 NXNL1Q96CM4 212 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CAPN8A6NHC0 703 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ADH5P11766 374 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 KCNE1P15382 129 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 KCNJ11Q14654 390 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 KREMEN2Q8NCW0 462 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 OR10A6Q8NH74 314 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 SAMD11Q96NU1 681 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
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