RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PAQR7Q86WK9 346 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 VSIG1Q86XK7 387 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A41Q8N5S1 370 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PHC3Q8NDX5 983 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.52□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 FAF2Q96CS3 445 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF157Q96PX1 679 aa7.52□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.52□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.52□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC53A6NM62 1247 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF487B1APH4 448 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 AP2A1O95782 977 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 S1PR4O95977 384 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT11Q9BT88 431 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP41Q9BYV8 373 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.51□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SPG11Q96JI7 2443 aa7.51□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 TARM1B6A8C7 271 aa7.5□□□□□ -1.21
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PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R50P59544 299 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MYL5Q02045 173 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TFDP2Q14188 446 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPSAP1Q14558 356 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZIC1Q15915 447 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MEP1AQ16819 746 aa7.5□□□□□ -1.21
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