RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 PRLHRP49683 370 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 DGKEP52429 567 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 CHIT1Q13231 466 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 CKAP5Q14008 2032 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TLR1Q15399 786 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 IZUMO2Q6UXV1 221 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 DHDDSQ86SQ9 333 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 NLRP8Q86W28 1048 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 UCMAQ8WVF2 138 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SELENOMQ8WWX9 145 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 S1PR5Q9H228 398 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 E7EQ34 232 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 H3BQ06 376 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 K7EQS6 105 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 MAP3K13O43283 966 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 ATG13O75143 517 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 FKBP6O75344 327 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 POP7O75817 140 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 NCK1P16333 377 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PTGER1P34995 402 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 RFX3P48380 749 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 ATP4BP51164 291 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 POLE2P56282 527 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SELPLGQ14242 412 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 FGL2Q14314 439 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 KIAA0040Q15053 153 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 MAPRE2Q15555 327 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SYTL3Q4VX76 610 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 AGTRAPQ6RW13 159 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 APIPQ96GX9 242 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 IL17FQ96PD4 163 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TSSK3Q96PN8 268 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 VPS35Q96QK1 796 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 ALG2Q9H553 416 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PLAGL1Q9UM63 463 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 CCDC154A6NI56 674 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 H3BM21 787 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TRIM38O00635 465 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SLC31A1O15431 190 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PAPLNO95428 1278 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PCCBP05166 539 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 C8GP07360 202 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 EBLN1P0CF75 366 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 NFKBIAP25963 317 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 IMPA1P29218 277 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 AQP1P29972 269 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 KCNK10P57789 538 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PHC1P78364 1004 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 CDC16Q13042 620 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 ADAM15Q13444 863 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 BIRC2Q13490 618 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 NFYCQ13952 458 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 KRT33BQ14525 404 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 GSTA3Q16772 222 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 LDLRAP1Q5SW96 308 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 HEATR4Q86WZ0 1026 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 LIX1Q8N485 282 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 CPA6Q8N4T0 437 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 DEFB119Q8N690 84 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TIFAQ96CG3 184 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PKP4Q99569 1192 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PKP2Q99959 881 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 MCM8Q9UJA3 840 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 U3KQV3 271 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 SCN2AQ99250 2005 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 FTH1P02794 183 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 ATP6V1B2P21281 511 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 GRIA3P42263 894 aa5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
USP15-201ENST00000280377 MTPNP58546 118 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms