RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280245.8

CCDC83-201, Transcript of coiled-coil domain containing 83, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene CCDC83, Length 2,358 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83-201ENST00000280245 ANAPC2Q9UJX6 822 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 OAZ3Q9UMX2 235 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 EYSQ5T1H1 3165 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 E7EQ34 232 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 CLGNO14967 610 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 SLC16A8O95907 504 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 SDC1P18827 310 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 PROSER1Q86XN7 944 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 OR10A6Q8NH74 314 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 GLMNQ92990 594 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 APOLD1Q96LR9 279 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 OR4K3Q96R72 315 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 OSBPL11Q9BXB4 747 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 A0A1B0GTW7 788 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 PSMD11O00231 422 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 QSOX1O00391 747 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 PLOD2O00469 737 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 NPC1O15118 1278 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 JUPP14923 745 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 NRIP1P48552 1158 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 CLDN8P56748 225 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 IRF8Q02556 426 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 NAE1Q13564 534 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 LIN52Q52LA3 116 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 MED8Q96G25 268 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 PPT2Q9UMR5 302 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC83-201ENST00000280245 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 KANSL1LA0AUZ9 987 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 H0Y858 1186 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ACOX3O15254 700 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 LRATO95237 230 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 NFATC1O95644 943 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 FAM58BPP0C7Q3 252 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 AMD1P17707 334 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 PRPH2P23942 346 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ITGB7P26010 798 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 CYP4F3Q08477 520 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF234Q14588 700 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 NLRP8Q86W28 1048 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ANKRD46Q86W74 232 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 CARM1Q86X55 608 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 NRSN1Q8IZ57 195 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 C10orf111Q8N326 155 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 SMARCD2Q92925 531 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 FAM129BQ96TA1 746 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 CENPKQ9BS16 269 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 SERHLQ9NQF3 203 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 HPS4Q9NQG7 708 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 CEP290O15078 2479 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 TNFAIP8O95379 198 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 UMPSP11172 480 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 GGT1P19440 569 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 IMPA1P29218 277 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 KCNC3Q14003 757 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 XKR6Q5GH73 641 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 PHACTR4Q8IZ21 702 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 OR2T12Q8NG77 320 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 RNF145Q96MT1 663 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 EBPLQ9BY08 206 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 MMP20O60882 483 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 C6P13671 934 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ADRB3P13945 408 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 PEX19P40855 299 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 DOC2AQ14183 400 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 SATL1Q86VE3 508 aa15.94■□□□□ 0.14
CCDC83-201ENST00000280245 TMIEQ8NEW7 156 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms