RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 ANHXE9PGG2 379 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 NPIPB8E9PQR5 432 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 PEX2P28328 305 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ACADLP28330 430 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 DOC2AQ14183 400 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 TRIP10Q15642 601 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 RABL3Q5HYI8 236 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 TDHQ8IZJ6 230 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2T3Q8NH03 318 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF480Q8WV37 535 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB18Q99592 522 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 DPY30Q9C005 99 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 NUMA1Q14980 2115 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CLGNO14967 610 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 RHDQ02161 417 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CYP2R1Q6VVX0 501 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 DHFR2Q86XF0 187 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ECSITQ9BQ95 431 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 NANOGQ9H9S0 305 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 NTSR1P30989 418 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM196Q5HYL7 178 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 LILRA2Q8N149 483 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF175Q8N4F7 328 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 APIPQ96GX9 242 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ABHD8Q96I13 439 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 GABRG3Q99928 467 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF576Q9H609 170 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CLMPQ9H6B4 373 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 COL4A2P08572 1712 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ATP6V1B2P21281 511 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CTHP32929 405 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 HNF4AP41235 474 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 GSK3BP49841 420 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF33BQ06732 778 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 BNIP2Q12982 314 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGRE1Q14246 886 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 FGL2Q14314 439 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 HID1Q8IV36 788 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM74Q96NL1 305 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 TEX101Q9BY14 249 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 VCX3BQ9H321 246 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.71■□□□□ 0.27
RABGGTA-201ENST00000216840 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.71■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 H0YIV9 168 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 STAMBPO95630 424 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 PRPS2P11908 318 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 TBPL1P62380 186 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 LIPEQ05469 1076 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 PWP1Q13610 501 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 INPP5AQ14642 412 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 IRF4Q15306 451 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 PRR23BQ6ZRT6 265 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRTM4Q86VH4 590 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 AMZ2Q86W34 360 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 SLCO4A1Q96BD0 722 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 LRGUKQ96M69 825 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 PKP2Q99959 881 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 LRCH1Q9Y2L9 728 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 F5P12259 2224 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 PEX1O43933 1283 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAM23O75077 832 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 EGFP01133 1207 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGGTA-201ENST00000216840 IL6P05231 212 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms