RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 BCKDHAP12694 445 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 HNF4AP41235 474 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF33BQ06732 778 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 DOC2AQ14183 400 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PRR23BQ6ZRT6 265 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 TDHQ8IZJ6 230 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2T3Q8NH03 318 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 SLAMF8Q9P0V8 285 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNE2Q9Y6J6 123 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PRPS2P11908 318 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PRPH2P23942 346 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 NTSR1P30989 418 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS14P62263 151 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA0040Q15053 153 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 AAK1Q2M2I8 961 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 RABL3Q5HYI8 236 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 SUSD1Q6UWL2 747 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRTM4Q86VH4 590 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 AMZ2Q86W34 360 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC13A3Q8WWT9 602 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM8Q9BZR9 551 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 ALG2Q9H553 416 aa23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 SERTM1A2A2V5 107 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 IL6P05231 212 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 HTR4Q13639 388 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 GRAMD1BQ3KR37 738 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 NANOGP8Q6NSW7 305 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 HID1Q8IV36 788 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA2013Q8IYS2 634 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 OR9A1PQ8NGU1 263 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF480Q8WV37 535 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 OR4K3Q96R72 315 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 NANOGQ9H9S0 305 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 AP4S1Q9Y587 144 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNH1O95259 989 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 GRIA3P42263 894 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 ADGRE1Q14246 886 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 GRHL2Q6ISB3 625 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 C11orf96Q7Z7L8 435 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 IFNEQ86WN2 208 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM126BQ8IUX1 230 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2T34Q8NGX1 318 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 CLHC1Q8NHS4 586 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 ZUFSPQ96AP4 578 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF576Q9H609 170 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXL12Q9NXK8 326 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 EGFL7Q9UHF1 273 aa23.23■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 DNTTP04053 509 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PCSK2P16519 638 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 CD22P20273 847 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 TBPL1P62380 186 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 YBX1P67809 324 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 LIPEQ05469 1076 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PWP1Q13610 501 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 MAPKAPK3Q16644 382 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 NUDT8Q8WV74 236 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 EFHD1Q9BUP0 239 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 LGR4Q9BXB1 951 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 CLMPQ9H6B4 373 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR26Q9H7D7 661 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 SGK2Q9HBY8 427 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 ITM2CQ9NQX7 267 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 ASF1AQ9Y294 204 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa23.22■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PRR23AA6NEV1 266 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 GSK3BP49841 420 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 RPA4Q13156 261 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 SGCGQ13326 291 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 INPP5AQ14642 412 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 AGERQ15109 404 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA1211LQ6NV74 962 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 UNC5DQ6UXZ4 953 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 APIPQ96GX9 242 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PPM1MQ96MI6 270 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM74Q96NL1 305 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 MUC13Q9H3R2 512 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 DYRK1BQ9Y463 629 aa23.21■■□□□ 1.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms