RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 IP6K3Q96PC2 410 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MENTQ9BUN1 341 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGEB16A2A368 324 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 DNAJB5O75953 348 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM63AO94886 807 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 KRT14P02533 472 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 ESR1P03372 595 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MLNP12872 115 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 NR1D1P20393 614 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGP20916 626 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP5DP30049 168 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 PTGIRP43119 386 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 VPS41P49754 854 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 PGDP52209 483 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 RRADP55042 308 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 FOXK1P85037 733 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 GRB7Q14451 532 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 CPZQ66K79 652 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MED25Q71SY5 747 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 LPGAT1Q92604 370 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 DLG3Q92796 817 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 GBP5Q96PP8 586 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 NDC1Q9BTX1 674 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 EURLQ9NYK6 297 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 K7EM74 188 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 HCRTR1O43613 425 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 C1orf105O95561 183 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 CBSLP0DN79 551 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 CBSP35520 551 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 CCL11P51671 97 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 ARSFP54793 590 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MLIPQ5VWP3 458 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 CASC4Q6P4E1 433 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 CES3Q6UWW8 571 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MCUQ8NE86 351 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 BIRC8Q96P09 236 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 IL17FQ96PD4 163 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 TARM1B6A8C7 271 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CEACAM4O75871 244 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 IGHEP01854 428 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FMO4P31512 558 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CHAF1BQ13112 559 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 SSPNQ14714 243 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CYP1B1Q16678 543 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 TCTE1Q5JU00 501 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 C1orf189Q5VU69 101 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 NEPROQ6NW34 567 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 TTC27Q6P3X3 843 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 HPS6Q86YV9 775 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZBTB2Q8N680 514 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-204ENST00000639439 AVILO75366 819 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms