RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	MATN4	O95460	622 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	S1PR4	O95977	384 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ALPL	P05186	524 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	POU2F2	P09086	479 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	UBL4A	P11441	157 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PSMA3	P25788	255 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CSNK1D	P48730	415 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	P2RX3	P56373	397 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MAPK11	Q15759	364 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OR4L1	Q8NH43	312 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PROX1	Q92786	737 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	LMLN	Q96KR4	655 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	NOTCH4	Q99466	2003 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF197	O14709	1029 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FZD6	O60353	706 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GPX3	P22352	226 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	RRM2	P31350	389 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	IFNA8	P32881	189 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	PGGT1B	P53609	377 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ERVK-21	P61565	698 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF460	Q14592	562 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	HORMAD1	Q86X24	394 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM25	Q86YD3	366 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	FAM110B	Q8TC76	370 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	HTRA1	Q92743	480 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM14	Q96QK8	99 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	POMK	Q9H5K3	350 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	USE1	Q9NZ43	259 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0J9YYE9	177 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM233	B4DJY2	109 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659		H0Y858	1186 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	B4GAT1	O43505	415 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ICMT	O60725	284 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KCNK2	O95069	426 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SNX4	O95219	450 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRAMEF12	O95522	483 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC6A2	P23975	617 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRIM2	P49643	509 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FADD	Q13158	208 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF77	Q15935	545 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FXN	Q16595	210 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PNCK	Q6P2M8	343 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC103	Q8IW40	242 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IRF7	Q92985	503 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	YIPF6	Q96EC8	236 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CHID1	Q9BWS9	393 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ALG2	Q9H553	416 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C12orf10	Q9HB07	376 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		14.96	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MYO7A	Q13402	2215 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CENPX	A8MT69	81 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659		B8ZZF3	427 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TOR1B	O14657	336 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HTR1A	P08908	422 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TCF3	P15923	654 aa		14.95	□□□□□ -0.02

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