RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ATRNO75882 1429 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A6P31641 620 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GLP1RP43220 463 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MARCKSL1P49006 195 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DSG2Q14126 1118 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 BIRC8Q96P09 236 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ASTN1O14525 1302 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AQP12BA6NM10 295 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 H7C417 338 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CD36P16671 472 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HSD17B7P56937 341 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HERV-K104P61576 105 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2BQ00403 316 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 FAM35AQ86V20 835 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 NFAT5O94916 1531 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 ZNF35P13682 527 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SUSD6Q92537 303 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 COQ8BQ96D53 544 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MAGP20916 626 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CD72P21854 359 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ACVR2AP27037 513 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HSD11B2P80365 405 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GRIK4Q16099 956 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SNTG2Q9NY99 539 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 C5orf60A6NFR6 353 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 D6RAR5 112 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HOXA9P31269 272 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PET117Q6UWS5 81 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF627Q7L945 461 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC10Q969S8 669 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ATG4CQ96DT6 458 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 IFT27Q9BW83 186 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM100Q9NV29 134 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 BANF1O75531 89 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TLE2Q04725 743 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 FSTL1Q12841 308 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 GRK1Q15835 563 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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PTPRT-209ENST00000612229 GPR65Q8IYL9 337 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MAPK15Q8TD08 544 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 KXD1Q9BQD3 176 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.85□□□□□ -1.31
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