RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 VRK3Q8IV63 474 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 TBC1D21Q8IYX1 336 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 RCOR2Q8IZ40 523 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 OR11G2Q8NGC1 345 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ACTL9Q8TC94 416 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 AGAP4Q96P64 663 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 IL17FQ96PD4 163 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 TBL1YQ9BQ87 522 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 NDC1Q9BTX1 674 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 MENTQ9BUN1 341 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ARNT2Q9HBZ2 717 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 IRAK4Q9NWZ3 460 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PLA2G3Q9NZ20 509 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.242e-8■■■□□ 18.1
FCHO1-228ENST00000599236 KLHL41O60662 606 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 JRKO75564 520 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CD63P08962 238 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 TDGF1P3P51864 188 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 GRB7Q14451 532 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 SLC5A12Q1EHB4 618 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 AADACL2Q6P093 401 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 OR5K2Q8NHB8 316 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 HEXDCQ8WVB3 486 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ELMO1Q92556 727 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 C8orf44Q96CB5 159 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC42Q96M95 316 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 LHPPQ9H008 270 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ABHD10Q9NUJ1 306 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 OR6C2Q9NZP2 312 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 COPG2Q9UBF2 871 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.54□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 A0A1B0GX78 115 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 VSTM2BA6NLU5 285 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 H7C0S8 307 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KCNN4O15554 427 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 OR1I1O60431 355 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 NRP2O60462 931 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 APOC2P02655 101 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KCTD11Q693B1 232 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 LAPTM4BQ86VI4 370 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 TAX1BP1Q86VP1 789 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PRSS58Q8IYP2 241 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 OR1N1Q8NGS0 311 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 PSMF1Q92530 271 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 RELTQ969Z4 430 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 SLC26A1Q9H2B4 701 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CUTCQ9NTM9 273 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 IMPACTQ9P2X3 320 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 CACNA1CQ13936 2221 aa13.53□□□□□ -0.24
FCHO1-228ENST00000599236 KRT87PA6NCN2 255 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 DSCR3O14972 297 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 KRT38O76015 456 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 METTL18O95568 372 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 AP2A1O95782 977 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 F10P00742 488 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 ALBP02768 609 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 CELA2AP08217 269 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 PKLRP30613 574 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 CCR7P32248 378 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 PER3P56645 1201 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 YBX1P67809 324 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 TPM4P67936 248 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 POU6F1Q14863 301 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 KIR2DS3Q14952 304 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 TLR1Q15399 786 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 ISLR2Q6UXK2 745 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 FKBP10Q96AY3 582 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 NACC2Q96BF6 587 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF160Q9HCG1 818 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 POLG2Q9UHN1 485 aa13.52□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 GTF3C1Q12789 2109 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 PCDH17O14917 1159 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 CTSVO60911 334 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 AP2A2O94973 939 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 RBP3P10745 1247 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 PSMA3P25788 255 aa13.51□□□□□ -0.25
FCHO1-228ENST00000599236 MST1P26927 711 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms