RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 NBASA2RRP1 2371 aa20.41■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 PIPSLA2A3N6 862 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 WISP1O95388 367 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 UGT2B7P16662 529 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 PTPN4P29074 926 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 CCR7P32248 378 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 SHMT2P34897 504 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 SLMAPQ14BN4 828 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 LCN10Q6JVE6 187 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 CEP128Q6ZU80 1094 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 VRK3Q8IV63 474 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 MR1Q95460 341 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 OR2A14Q96R47 310 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 TTC1Q99614 292 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 CHST8Q9H2A9 424 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 FANCEQ9HB96 536 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC25A39-216ENST00000592857 IQCF5A8MTL0 148 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SASH3O75995 380 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PMS2P54278 862 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 IL10RAQ13651 578 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ZIC1Q15915 447 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 HIF1AQ16665 826 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 DSELQ8IZU8 1212 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MCUQ8NE86 351 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 POLG2Q9UHN1 485 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MEN1O00255 615 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MAP2K7O14733 419 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ATP8B1O43520 1251 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 GPC4O75487 556 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 NMBRP28336 390 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 HSD17B3P37058 310 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 GABRA4P48169 554 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ARL4CP56559 192 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CDK16Q00536 496 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CBLBQ13191 982 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 UGT8Q16880 541 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CENPUQ71F23 418 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SYVN1Q86TM6 617 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MENTQ9BUN1 341 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 IL22Q9GZX6 179 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 P2RY12Q9H244 342 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM60AQ9NP50 221 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 E7ESA3 106 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 F8W8V4 182 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 H3BMH7 237 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 K7EM74 188 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 HCRTR1O43613 425 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CAPN1P07384 714 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ARNTP27540 789 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 PKLRP30613 574 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 GRB7Q14451 532 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM198BQ6UWH4 519 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 RELL1Q8IUW5 271 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 KRT222Q8N1A0 295 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SERPINB12Q96P63 405 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 EPN3Q9H201 632 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CLMPQ9H6B4 373 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 SYBUQ9NX95 663 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 FER1L5A0AVI2 2057 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 BANF1O75531 89 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 RFPL1O75677 317 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 NR1D1P20393 614 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CYP2A7P20853 494 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A39-216ENST00000592857 MGAT1P26572 445 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms