RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587260.1

NFIX-208, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFIX, Length 1,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-208ENST00000587260 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SFRP1Q8N474 314 aa14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 MAPK15Q8TD08 544 aa14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 FBXL8Q96CD0 374 aa14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.5□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 A0A0G2JNG1 304 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 TRIM38O00635 465 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ITM2AO43736 263 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 NOBOXO60393 691 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ALPPL2P10696 532 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 MYF5P13349 255 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ARRB2P32121 409 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SLC19A1P41440 591 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 KIR2DS5Q14953 304 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 CFAP157Q5JU67 520 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 EID2Q8N6I1 236 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ATL1Q8WXF7 558 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 NRTNQ99748 197 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 EGFL8Q99944 293 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 HAO1Q9UJM8 370 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.49□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 OR5K4A6NMS3 321 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 PROB1E7EW31 1015 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 E2F3O00716 465 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 PCDHGA12O60330 932 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 LRP3O75074 770 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SUPT7LO94864 414 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 TGDSO95455 350 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 VIPP01282 170 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 DRD4P21917 467 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SLC6A12P48065 614 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 AGTR2P50052 363 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 BIRC2Q13490 618 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 GRB7Q14451 532 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 LSMEM2Q8N112 164 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ARL14Q8N4G2 192 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ARL10Q8N8L6 244 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 OR4C6Q8NH72 309 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SORT1Q99523 831 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 PKP4Q99569 1192 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 CD244Q9BZW8 370 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 POT1Q9NUX5 634 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 PCTPQ9UKL6 214 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.48□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 SIGLEC6O43699 453 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 FAM107AO95990 144 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 HSD17B2P37059 387 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 PLA2G5P39877 138 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 HHEXQ03014 270 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 GPR18Q14330 331 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 PLCL1Q15111 1095 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 GPR156Q8NFN8 814 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 MOCOSQ96EN8 888 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 IL17FQ96PD4 163 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.47□□□□□ -0.09
NFIX-208ENST00000587260 XKR8Q9H6D3 395 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms