RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.92■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.92■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.92■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC22A4Q9H015 551 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 NIPSNAP2O75323 286 aa20.9■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
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PTPRM-211ENST00000580170 B3GALT2O43825 422 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 EIPR1Q53HC9 387 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
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