RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557696.5

CLMN-209, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 746 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-209ENST00000557696 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 WWOXQ9NZC7 414 aa9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TMEM131Q92545 1883 aa9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 USP34Q70CQ2 3546 aa9.51□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PROB1E7EW31 1015 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SIGLEC6O43699 453 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 KLK8O60259 260 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SLC16A8O95907 504 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 BPGMP07738 259 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 MYF5P13349 255 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 IMPA1P29218 277 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PKLRP30613 574 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ALDH3A1P30838 453 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 GRK6P43250 576 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 FASLGP48023 281 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 HNMTP50135 292 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 NFKB2Q00653 900 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 NHLH1Q02575 133 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SETDB1Q15047 1291 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 NR0B2Q15466 257 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 INAVAQ3KP66 663 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ZNF480Q8WV37 535 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 LCN9Q8WX39 176 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ATL1Q8WXF7 558 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 FBXL8Q96CD0 374 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 CCDC126Q96EE4 140 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 MED8Q96G25 268 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 APOLD1Q96LR9 279 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SLC38A3Q99624 504 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TMCO1Q9UM00 188 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ICKQ9UPZ9 632 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 RNF215Q9Y6U7 377 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 DMDP11532 3685 aa9.5□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ZNF839A8K0R7 811 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 STX16O14662 325 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PPM1DO15297 605 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TAPBPO15533 448 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 FLRT2O43155 660 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 NEFHP12036 1026 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TGM1P22735 817 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 SHMT2P34897 504 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 HSD17B2P37059 387 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 GDF5P43026 501 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 HSPA7P48741 367 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 AGTR2P50052 363 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 RAB28P51157 221 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PNLIPRP1P54315 467 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 PRKAA2P54646 552 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TBPL1P62380 186 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 NAE1Q13564 534 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 LIPMQ5VYY2 423 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ANKS6Q68DC2 871 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.49□□□□□ -0.89
CLMN-209ENST00000557696 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms