RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	MATN4	O95460	622 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PVR	P15151	417 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FOLR1	P15328	257 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GABRB3	P28472	473 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PHB	P35232	272 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CDKN2D	P55273	166 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	IL2	P60568	153 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TUBB4B	P68371	445 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CXADR	P78310	365 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TLE3	Q04726	772 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TGIF1	Q15583	401 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TRADD	Q15628	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GPR19	Q15760	415 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	D2HGDH	Q8N465	521 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	OR2A14	Q96R47	310 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FMO2	Q99518	471 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.37	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MT-ND3	P03897	115 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	C8G	P07360	202 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FGF5	P12034	268 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	HSD17B2	P37059	387 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CBLB	Q13191	982 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	OR8K5	Q8NH50	307 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TCTN2	Q96GX1	697 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CPNE1	Q99829	537 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.36	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KRT87P	A6NCN2	255 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MYO1C	O00159	1063 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SCRG1	O75711	98 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KRT37	O76014	449 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CCNDBP1	O95273	360 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FDXR	P22570	491 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CMPK1	P30085	196 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GP5	P40197	560 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SP140	Q13342	867 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GRB7	Q14451	532 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	VASH2	Q86V25	355 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ESX1	Q8N693	406 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ASB11	Q8WXH4	323 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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