RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-222ENST00000531967 A0A1W2PQC6 194 aa5.09□□□□□ -1.59
ECHDC1-222ENST00000531967 A0A1W2PQD8 194 aa5.09□□□□□ -1.59
ECHDC1-222ENST00000531967 A8MUI8 341 aa5.09□□□□□ -1.59
ECHDC1-222ENST00000531967 PPIP5K2O43314 1243 aa5.09□□□□□ -1.59
ECHDC1-222ENST00000531967 B4GALT4O60513 344 aa5.09□□□□□ -1.59
ECHDC1-222ENST00000531967 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
ECHDC1-222ENST00000531967 SPATA31D3P0C874 917 aa5.09□□□□□ -1.59
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ECHDC1-222ENST00000531967 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.09□□□□□ -1.59
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ECHDC1-222ENST00000531967 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
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ECHDC1-222ENST00000531967 DFNA5O60443 496 aa5.09□□□□□ -1.6
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ECHDC1-222ENST00000531967 PRRC1Q96M27 445 aa5.09□□□□□ -1.6
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ECHDC1-222ENST00000531967 WDR76Q9H967 626 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 ZFP14Q9HCL3 533 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 HHATLQ9HCP6 504 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 PIGVQ9NUD9 493 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 RDH8Q9NYR8 311 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 STAP1Q9ULZ2 295 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.09□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.6
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ECHDC1-222ENST00000531967 MBD5Q9P267 1494 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 WDR62O43379 1518 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 A0A0J9YYE9 177 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 NDUFS4O43181 175 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 SEC14L5O43304 696 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 RNF13O43567 381 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 OR6A2O95222 327 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 TRBC1P01850 177 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 TFP02787 698 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 ICAM1P05362 532 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 TMEM225BP0DP42 221 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 ITGA3P26006 1051 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 HLA-FP30511 346 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 CXCR5P32302 372 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 SHMT1P34896 483 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 RORAP35398 523 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 NCKAP1LP55160 1127 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 CNTN2Q02246 1040 aa5.08□□□□□ -1.6
ECHDC1-222ENST00000531967 ENPP2Q13822 863 aa5.08□□□□□ -1.6
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