RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526539.2

SLC38A6-209, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

TSL 4

Gene SLC38A6, Length 755 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-209ENST00000526539 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 PREBQ9HCU5 417 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SMOXQ9NWM0 555 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 IL17CQ9P0M4 197 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 MID2Q9UJV3 735 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ZNF711Q9Y462 761 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 LAMA3Q16787 3333 aa7.06□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 TTC34A8MYJ7 566 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 K7EQS6 105 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CYR61O00622 381 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 USP12O75317 370 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 VAPBO95292 243 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 IL1BP01584 269 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 APOA4P06727 396 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 GSTA1P08263 222 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ELFN1P0C7U0 828 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ACADMP11310 421 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ADRB3P13945 408 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 MTHFD2P13995 350 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 HOXB2P14652 356 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 HK1P19367 917 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CRABP2P29373 138 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SSTR1P30872 391 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 MMP12P39900 470 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 IL12RB1P42701 662 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 GPR3P46089 330 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CD151P48509 253 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CCT5P48643 541 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SERPINB8P50452 374 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SLC12A2P55011 1212 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 GPX6P59796 221 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 NAA20P61599 178 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 DPTQ07507 201 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 GALNT3Q14435 633 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SPARCL1Q14515 664 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CST6Q15828 149 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 INSCQ1MX18 579 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ZNF284Q2VY69 593 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 TOR2AQ5JU69 321 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 EMC10Q5UCC4 262 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 Q7L0L9 218 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 DOK3Q7L591 496 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SYT13Q7L8C5 426 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SNX20Q7Z614 316 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 OR52N2Q8NGI0 321 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SMC6Q96SB8 1091 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 RHOJQ9H4E5 214 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SGK2Q9HBY8 427 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ZNF446Q9NWS9 450 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 MKS1Q9NXB0 559 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 OGFRQ9NZT2 677 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.05□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 A0A0C4DFX4 3053 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 LRRC72A6NJI9 287 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 AGAP14A8MT82 685 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 K7ESF4 209 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 AREL1O15033 823 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 TM9SF1O15321 606 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 NDUFS3O75489 264 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 AP2A2O94973 939 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 ZWINTO95229 277 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 GASTP01350 101 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 IGLV3-19P01714 112 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 MT-ND3P03897 115 aa7.04□□□□□ -1.28
SLC38A6-209ENST00000526539 SLPIP03973 132 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms