RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	PTGES	O14684	152 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	HS3ST1	O14792	307 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF217	O75362	1048 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	APBB3	O95704	486 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LCAT	P04180	440 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	DANCR	P0C864	163 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PDHB	P11177	359 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MYL6B	P14649	208 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MAOA	P21397	527 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	HRH2	P25021	359 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ADSS	P30520	456 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFSF8	P32971	234 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PEX19	P40855	299 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	NPBWR1	P48145	328 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ME1	P48163	572 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CDH12	P55289	794 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00205	P59089	165 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	GCNT1	Q02742	428 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXM1	Q08050	763 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	GRIK2	Q13002	908 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	NR1D2	Q14995	579 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	DCST1	Q5T197	706 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SHC4	Q6S5L8	630 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	NRAC	Q8N912	160 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	BBS10	Q8TAM1	723 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	BICD2	Q8TD16	824 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB7B	Q96AH8	199 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	EME1	Q96AY2	570 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF333	Q96JL9	665 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM81B	Q96LP2	452 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	OR6C1	Q96RD1	312 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FEV	Q99581	238 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	CARD6	Q9BX69	1037 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF146	Q9NTX7	359 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPRG	P23470	1445 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	MIA2	Q96PC5	1412 aa		3.84	□□□□□ -1.79
FAM49B-222	ENST00000522702	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		3.84	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		3.84	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	KPNA7	A9QM74	516 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702		E5RJQ4	531 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	PLK4	O00444	970 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	GMFG	O60234	142 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP9A	O75110	1047 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP6V1G1	O75348	118 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	SCGB2A1	O75556	95 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	AK1	P00568	194 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2T7	P0C7T2	308 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	UGT1A6	P19224	532 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A6	P31641	620 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEB1	P43366	347 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	LHX1	P48742	406 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	SULT1E1	P49888	294 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	NUDT6	P53370	316 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPK12	P53778	367 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	MTCP1	P56278	107 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	CD81	P60033	236 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	GHRHR	Q02643	423 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	ELP6	Q0PNE2	266 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	SGCG	Q13326	291 aa		3.83	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	TRADD	Q15628	312 aa		3.83	□□□□□ -1.8

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